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樣品被蛋白酶降解,處理方法:添加蛋白酶抑制劑(protease inhibitor);所有操作保持4℃以下冰上操作并防止凍融。
抗體濃度太低,處理方法:調(diào)整IP和/或IB抗體濃度, 必要時設(shè)立濃度梯度,摸索最佳濃度;
抗體親合力太低,處理方法:選用適合于IP和/或IB的相應(yīng)抗體;
IP抗體未與agarose珠子結(jié)合,處理方法:選用適合于IP的相應(yīng)珠子, 正確保存防止變質(zhì)或干燥;
Tag未暴露在融合蛋白構(gòu)象的表面,處理方法:改變tag融合表達部位;
裂解液嚴謹度太高,處理方法:改用低嚴謹度裂解液。

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